Unicamp, Unesp e USP criam plataforma grátis para análise genômica

Uma cooperação entre pesquisadores da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), da Universidade Estadual Paulista (Unesp) e da Universidade de São Paulo (USP), com apoio do Institut Pasteur de São Paulo, resultou no desenvolvimento da CellForgeR. A plataforma on-line e gratuita é a primeira solução nacional voltada à análise de dados genéticos complexos sem a necessidade de programação.

A ferramenta foca no sequenciamento de RNA de célula única (single-cell RNA-seq), metodologia avançada que identifica quais genes estão ativos em cada célula individualmente, superando a análise tradicional por blocos de tecido.

Salto tecnológico e acessibilidade no SUS e universidades

Até então, o processamento desse volume colossal de dados exigia profissionais especializados em bioinformática e infraestruturas computacionais de altíssimo custo — gargalos frequentes na ciência brasileira.

"Se o pesquisador sabe usar uma planilha de Excel, agora também consegue analisar dados de células únicas", explica Diogo de Moraes, pesquisador da Unesp e um dos criadores do software. A plataforma roda diretamente no data center do Instituto de Biologia da Unicamp e é acessada pelo navegador, permitindo a seleção de parâmetros e genes por menus intuitivos.

Aplicações em câncer e doenças metabólicas

O nível de resolução celular propiciado pela plataforma permite mapear estados imunológicos detalhados em tumores e no sistema nervoso, além de refinar a compreensão de doenças metabólicas.

"Essa metodologia nos permite enxergar as células num nível de detalhes inédito. O impacto é comparável ao salto que o microscópio eletrônico trouxe à biologia", pontua Marcelo Mori, professor da Unicamp. A ferramenta aceita dados próprios de laboratórios ou repositórios públicos internacionais, estimulando a reanálise de pesquisas sem custos operacionais adicionais. O acesso é gratuito mediante cadastro da equipe médica e científica na plataforma.